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1、正常剂量使用时，枯草杆菌二联活菌颗粒一般副作用较小，极少数儿童会出现腹泻次数增多的现象。

2、停药后一般可恢复正常，可能与对枯草杆菌二联活菌颗粒口服过敏有关，另外枯草杆菌二联活菌颗粒其主要成分为屎肠球菌和枯草杆菌。

3、两者都能直接补充正常生理菌群，抑制致病菌繁殖，从而促进营养物质的消化吸收。

4、抑制长生毒素的产生与吸收，达到调节肠道内菌群失调的目的。

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