从细菌到人类，生物都在一系列相互关联的代谢途径上运行-糖酵解是从食物中的糖(葡萄糖)中产生能量的基本过程。丙酮酸是糖酵解的最终产物：它是一个重要的分子，在不同途径之间起着节点的作用。为了更好地了解这些途径如何发挥作用，由明治大学的岛田智宏博士，法政大学的石滨彰博士和东京工业大学(东京理工大学)的今村修介博士领导的一组科学家决定研究一种称为“ PdhR”的蛋白质，是大肠杆菌(一种常见的模式生物)中丙酮酸分解代谢(或分解)的主要调节剂。他们从以前的研究中知道，PdhR调节着至少9种参与碳代谢途径(糖分解为能量源)的蛋白质的表达。但是，考虑到丙酮酸从清除自由基到产生氨基酸的多种作用，合理地认为PdhR具有多个靶标。

研究人员使用了一种称为gSELEX(基因组SELEX)筛选的方法，其中将PdhR与小片段的大肠杆菌基因组混合。PdhR被标记了一个标记，该标记使研究人员能够分离PdhR的靶标。这导致成功鉴定了PdhR的多个靶标。Shimada博士解释说：“通过这种方式，我们能够找到16-27个PdhR可能的靶标。” “然后，我们决定分析以前从未发现过的那些。目标是找到涉及PdhR的新途径。”

该团队确定了参与细菌运动的PdhR调控靶标，特别是充当影响鞭毛基因(许多细菌用来移动附件的基因)的阻遏物。他们还发现，PdhR通过抑制抑制该过程的蛋白质来调节脂肪酸(细菌中的重要能源)的分解。换句话说，活性PdhR降低了细菌的迁移率并增加了脂肪酸的降解-PdhR的功能是全新的。此外，科学家还发现了其他受PdhR调控的碳代谢基因，包括在糖酵解，乳酸代谢和TCA循环过程中产生丙酮酸的酶。

科学家乐观地认为，从大肠杆菌中获得的这些发现可以应用于更复杂的多细胞动物。它们还可以帮助我们更好地控制大肠杆菌的代谢，这对生物工程和分子生物学实验具有重要意义。” Shimada博士总结说：“我们的工作使我们能够将PdhR的作用扩展到已知以外。由于丙酮酸浓度会影响PdhR活性，因此这些结果确实有助于我们更好地了解丙酮酸在大肠杆菌代谢中的关键核心作用。大肠杆菌是一种极为常见的细菌，对它的了解可以导致对医学领域的深刻了解。”