近年来,人们对理解心智运作的努力已经有了新发现的紧迫性。从阿尔茨海默氏病和中风到自闭症和焦虑症的心理和神经疾病不仅越来越普遍,而且出现了新的工具和方法,使科学家能够以更大的粒度探索大脑的结构和内部活动。
白宫于2013年4月2日启动了“大脑计划”,旨在支持创新技术的开发和应用,这些技术可以动态地理解大脑功能。该计划支持了超过10亿美元的研究,并产生了新见解,新药和新技术,以帮助患有脑部疾病的人。
但是,斯坦福大学计算机系心理学教授拉塞尔·波德拉克(Russell Poldrack)认为,大量研究工作面临挑战。心理学和神经科学都在努力依靠其不同研究人员的知识。
Poldrack以及斯坦福大学,达特茅斯学院和亚利桑那州立大学的合作者在2019年5月的《自然通讯》(Nature Communications)论文中写道:``科学本来就是累积性的,但方法论和概念性问题都阻碍了心理学的累积性进步。''
数据档案员
问题的一部分是实际的。数百个研究小组正在进行原始研究,因此需要一个中央存储库来托管和共享数据,比较和合并研究并鼓励数据重用。为了应对这一策展挑战,Poldrack于2010年推出了一个名为OpenFMRI的平台,用于共享fMRI研究。
Poldrack解释说:“长期以来,出于多种原因,我一直认为数据共享很重要,这是为了提高透明度和可重复性,还有助于我们汇总许多小型研究报告,以提高回答问题的能力。”
OpenFMRI已发展到近一百个数据集,并在2016年被纳入OpenNeuro,这是用于托管脑成像研究的更通用的平台。如今,该平台拥有220多个数据集,其中包括“斯德哥尔摩嗜睡脑研究”和“情绪低沉的音乐和非音乐刺激的神经处理”,已被下载了数百次。
脑成像数据集相对较大,需要较大的存储库来容纳它们。在开发OpenFMRI时,Poldrack求助于德克萨斯大学奥斯汀分校的德克萨斯高级计算中心(TACC)来托管和提供数据。
阿诺德基金会(Arnold Foundation)的一笔赠款使他在Amazon Web Services上托管OpenNeuro已有几年,但最近Poldrack再次求助于TACC和NSF资助的极限科学与工程发现环境(XSEDE)的一部分其他系统来提供服务作为数据库的网络基础架构。
该项目成功的部分原因是由于开发了通用标准BIDS(大脑成像数据结构(BIDS)),该标准使研究人员能够以苹果对苹果的方式进行比较和合并研究。由Poldrack等人于2016年推出,它获得了近乎即时的认可,并已发展成为用于神经影像数据的通用语言。