用于理解脑癌生长的计算机模拟
借助由纽卡斯尔大学协调的国际科学家开发的新计算机平台,可以更好地理解脑癌的生长。
纽卡斯尔大学,塞浦路斯大学,UCL和CERN的研究小组今天发表在《方法》杂志上,描述了他们如何开发三维模型,该模型将组织的宏观尺度与单个细胞的微观尺度结合在一起。这使该平台能够在保持解析力的同时,对癌症的机械生物学进行现实的建模,从而使其具有成本效益。
计算学院的Roman Bauer博士说:“基于最新的计算技术,BioDynaMo平台使用户能够以更大的规模和更高的复杂度执行模拟,从而有可能解决具有挑战性的科学研究问题。”
尽管存在许多专用软件工具,但建立此高性能通用平台是向前迈出的重要一步。
医学科学学院的博士生让·德蒙蒂尼(Jean de Montigny)表示:“对于科学家和医务人员来说,优点是BioDynaMo可用于标准笔记本电脑或台式计算机,并提供可轻松创建,运行和可视化3D的软件平台基于代理的生物模拟。”
胶质瘤
脑胶质瘤是源自神经干细胞和支持神经元的神经胶质细胞的一类广泛的脑和脊髓肿瘤。对患者(往往是成年人)的治疗包括通过手术切除尽可能多的肿瘤,然后进行化学疗法和放射疗法。
通过对神经胶质瘤的生长进行建模,临床医生可以更好地了解肿瘤如何发展和进展。然而,癌症研究人员将来可能会使用此类模型来改善相关治疗程序的结果。
本文开发了癌症的三维计算机模拟杂种模型,该模型描述了肿瘤和宿主细胞的多元表型行为。该模型包含细胞迁移和粘附的作用,细胞外基质的影响,氧气和养分利用率的影响,以及由化学线索和生长因子触发的信号传导。
与欧洲核子研究中心(CERN)合作,该项目在与纽卡斯尔大学的合作中贡献了其在大规模计算领域的深厚知识,该项目得到了英特尔的支持。
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