小鼠基因组的所有基因中创建一个全面的突变库
研究人员已经开发出一种方法,可以在小鼠基因组的所有基因中创建一个全面的突变库。该文库可用于检查每种基因在不同细胞类型中的作用。
CRISPR技术利用DNA切割酶Cas9,在指导RNA序列的帮助下,发现和修饰遗传靶标。科学家可以使用标准分子生物学技术轻松设计多种新的指导RNA。这使得修改任何物种中任何细胞类型的基因组的方法更加快速有效。
研究小组发现,52种引导RNA中的50种成功切割了两种基因拷贝。这些工程化指导RNA的极高成功率似乎在许多细胞类型中是一致的,这使得它们创建了针对小鼠基因组中每个基因的指导RNA文库。
“CRISPR技术正在彻底改变我们研究细胞行为的方式,”Wellcome Trust Sanger Institute的第一作者Kosuke Yusa博士说。“我们开发了一个完整的库,可供其他研究人员用来研究任何基因的作用。我们可以为任何细胞或任何物种创建这种类型的文库。”
该团队设计了一个包含近90,000种这些指导RNA的文库,可用于靶向和修饰小鼠基因组中的每个基因,并创建突变干细胞文库。他们将突变体文库用于针对细菌毒素,梭状芽孢杆菌α-毒素的遗传筛选,以更好地了解如何发生抗性:该药物对每种细胞类型都有毒性作用。
该研究小组针对26种已知与该细菌毒素受体合成有关的基因。他们发现这些基因中有17个是抵抗力的原因。重要的是,他们还发现了以前未知的基因,这些基因的突变赋予对这种毒性剂的抗性。
该团队现在将使用该库在癌细胞系中产生突变。癌症药物的一个主要问题是细胞通常可以迅速获得抗性并拒绝治疗。通过筛选通过突变失去所有功能的基因,该团队可以确定哪些基因参与获得对癌症治疗的抗性,从而找到临床目标。
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