通过先进的RNA测序,科学家们发现了许多急性髓性白血病(AML)患者中存在的两种独特的显着突变亚型-NPM1-可帮助预测存活率并改善白血病细胞携带突变的患者的治疗反应。
在2月16日发表于《自然通讯》上的研究中,玛格丽特公主癌症中心资深科学家Dr. Benjamin Haibe-Kains,Aaron Schimmer和Mark Minden发现,在AML的NPM1突变内,存在两种独特的亚型,其中一种可以用已经使用的药物进行有效治疗。
这是第一项在常见NPM1突变型AML中分类为两个亚型的研究,一个是“原始”,另一个是“承诺”。此外,研究表明,每种亚型对治疗和长期生存都有不同的反应,从而为个性化治疗计划和未来引入新的靶向疗法提供了机会。
“拥有NPM1突变AML的患者面临的复发率约为40%,”玛格丽特公主(隶属于大学健康网络)的研究总监兼急性白血病医生Schimmer博士说。“虽然我们在结合新的监测技术方面做得更好,但我们仍无法充分预测患者可能跌倒曲线的哪一点。
通过更深入地进行测序,我们可以更好地预测结果并相应地为每位患者调整治疗方案。”
NPM1突变型AML约占所有AML病例的30%,但这些患者的治疗发现受到限制。
多伦多大学医学生物物理学副教授Haibe-Kains博士说:“虽然NPM1突变相对普遍,但AML是一种罕见的疾病。” “产生足够的数据来测序和了解这种突变的生物学是非常具有挑战性的。”
这在很大程度上要归功于由资深科学家和医学肿瘤学家Minden博士以及玛格丽特公主癌症研究人员Andrea Arruda领导的团队,他们自1980年代中期以来就一直在收集样本以进行更深入的学习。对患者的意愿,慷慨和远见。
敏登博士说:“认识到那些'大海捞针'-不能从某些治疗中受益的一小群患者,对于改善个性化医学至关重要。” “现在,我们可以开始为这种谨慎的患者群体改善治疗效果。”
定制的高级计算模型可以分析从白血病活细胞组织库获得的患者白血病细胞中的RNA ,以及从NPM1突变型白血病研究中发表的其他数据。
Haibe-Kains博士说:“我们开发了一种独特的机器学习模型,该模型能够清楚地区分患者收集的数据集中的NPM1突变型AML的两种亚型。”
这两个亚型均含有突变型AML,但它们表达的基因不同,现在可以根据其RNA将它们分为两个清晰的亚型。
研究还表明,已经用于治疗其他类型癌症的某些药物可能对原始亚型有效。
Haibe-Kains博士解释说:“一旦我们能够确定每种亚型的模式,我们就会分析现有的药物基因组学数据,以缩小可能针对一种或另一种亚型的药物清单。” “我们发现两种药物似乎可以有效地靶向实验室中的原始亚型,并且有可能在将来进行临床试验。”
Schimmer博士说:“这一发现可能会改变我们治疗患者的方式。” “这为更好地改进和及时治疗提供了机会,无论是尽早进行干细胞移植的决定,还是在整个治疗过程中选择更有效,毒性更低的疗法。
我们对所有患者的目标是获得越来越好的结果。这是迈向更好的一步。”
这项研究得到了加拿大卫生研究院,白血病研究Orsino主席和玛格丽特公主癌症基金会的资助。
ADS已从武田制药和Medivir AB获得研究资金,并从武田,诺华,爵士和大冢制药获得咨询费/酬金。ADS在Abbvie中持有股票。ADS是声称使用DNT来治疗AML的专利申请的发明人。