随着越来越多的大规模人类基因组测序项目的完成，科学家们已经能够越来越有信心地跟踪人口的地理移动和潜在的遗传变异。

这些项目大多支持欧洲人口的研究，因此缺乏代表世界真实种族多样性的机会。

为了更好地了解西班牙裔前墨西哥人的广泛人口历史，并寻找适应性进化的迹象，由墨西哥科学家领导的一个国际小组对来自五个不同土著民族的78个个体的基因组或外显子的完整蛋白质编码区进行了测序。北(Rara？Muri或Tarahumara和Huichol)、中部(Nahua)、南部(Triqui或TRQ)和东南部(Maya或MYA)。基因组研究是针对美洲原住民的最大规模的基因组研究，最近发表在《分子生物学与进化》高级网络版。

主要作者说，“我们模拟了墨西哥土著的人口历史。北方和南方民族(塔拉乌马拉族和慧乔尔族)分裂为7.2 kya，然后在当地分别分裂为6.5 kya(慧乔尔族)和5.7 kya(特里基族和玛雅族)。”墨西哥国立自治大学的玛利亚A？维拉-阿科斯.由于那瓦语给整体分析带来噪音，最终分析时排除。

总的来说，他们在被研究的个体中发现了120，735个单核苷酸变异体(SNV ),这些变异体被用来追溯种群历史。此外，他们可以将自己的数据与美洲土著祖先的人口历史和化石记录进行核对。

“我们发现的分裂时间也与之前的估计有关，即印第安人的祖先将KYA分为17.5-14.6 KYA到南方印第安人或“祖先a”(包括中部和南部印第安人)和北方印第安人或“祖先b”，根据在墨西哥中部和尤卡坦半岛发现的最早的骨骼遗骸，可以追溯到大约12000年前，最初的定居发生在墨西哥。”阿维拉-阿尔科兹说。“对中美洲和南美洲古代遗骸的全基因组数据研究显示，在过去的8500年里，美洲一些地区的古代和现代人口之间存在遗传连续性。”

“这说明到那时，MYA的祖先种群还没有和其他种群发生遗传分化，所以我们对北/南划分的估计是7.2 KYA，而玛雅/特里基峰是5.7 KYA，符合这种情况。”