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器官和组织再生过程中染色质的动态变化

导读 来自巴塞罗纳大学遗传、微生物和统计系以及生物医学研究所(UB)的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因及其表达过程中所需的调控

来自巴塞罗纳大学遗传、微生物和统计系以及生物医学研究所(UB)的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因及其表达过程中所需的调控元件。以及组织和器官的再生。这项研究发表在《基因组研究杂志》的封面上,通过新一代测序,将经典的遗传分析与新的染色质研究技术相结合,为再生医学提供了新的视角。

这项研究的参与者是Elena Vizcaya-Molina(UB)和Cecilia C . Klein(UB-CRG),这是由Montserrat Corominas(UB)领导的本文的第一个签名者。其他合作者包括rodericgigig(CRG Pompeu fa bra大学)、Florenci Serras(UB)和Rakesh K. Mishra(CCMB海得拉巴)。

再生基因

本文作者分析了果蝇翅膀不同再生阶段成像盘的转录组。通过对大规模RNA测序的分析,他们确定了在这个过程中差异表达的那些基因。此外,他们发现这些基因中有30%以上位于基因簇中。作为对其他物种(小鼠和斑马鱼)比较分析的结果,作者发现了一组参与再生的基因,这些基因在所有这些物种中都是保守的。“知道哪些基因可以再生——这些基因有一些共同点,这可以帮助我们理解在再生技能更有限的生物(如人类)中激活这一过程所必需的东西,”埃琳娜维斯卡亚-莫利纳指出。

“这项研究表明,组学和生物信息学对于理解基本的生物学过程变得越来越重要,”CRG博士后研究员、密歇根大学讲师Cecilia Klein指出。新的测序技术和生物信息学分析与实验研究的结合使研究人员能够在理解基因调控方面取得进展,在这种情况下,是再生。

再生中的调节元件

在这项研究中,研究人员还首次发现了三种与再生有关的调控元件:在再生过程中增加活性的元件,从其他发育阶段或其他组织中重复使用的元件,以及最后一组,再生中的独特元件。“这些调控元件是DNA序列,可以导致和塑造基因表达,”Elena Vizcaya说。此外,作者发现这些元素可能被物种(苍蝇、老鼠和斑马鱼)中的一些保守基因激活。专家Montserrat Corominas总结说:“异位激活特定的再生调节元件可能是改善不能再生器官再生能力的关键工具。”

作为再生模式动物,苍蝇

自古以来,再生就引起了人们极大的兴趣,比如希腊神话中的传说。然而,果蝇的生殖能力,被称为黑腹果蝇,直到20世纪40年代才被发现,被一位再生医学之父发现。托马斯看到苍蝇的成像盘(成体表皮结构中的原始盘)被打破后可以再生。飞行被认为是研究再生的模型。

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