研究人员开发了一种新的高通量筛选方法,用于检测直接的生物分子相互作用。需要这样的筛选技术来揭示细胞构建模块是如何连接的,这对于理解细胞如何功能或在疾病中的功能是必不可少的。这种方法被设计成廉价和可行的,使其适用于每一个标准的生物医学研究实验室。
是蛋白质细胞的基石。它们完成大部分工作,这些工作对细胞和身体组织和器官的结构、功能和动态调节至关重要。蛋白质很少单独发挥作用。它们相互作用形成蛋白质复合物或结合DNA和RNA来控制细胞的行动。这些复合物是细胞中许多重要反应的关键部分,如能量代谢或基因调节。这些相互作用的任何变化(例如,它可能是由突变引起的)都可能改变健康和疾病。因此,为了了解细胞如何运行或细胞中可能出现什么问题,了解它们的构建模块如何相互作用是至关重要的。
新技术使科学家在过去几十年里知道了生物体的遗传信息,哪些信息被积极利用,哪些蛋白质是细胞在不同条件下制造的。现在,理解蛋白质和RNA信使分子等生物分子如何结合形成功能细胞所需的复合物是一个巨大的挑战。换句话说,我们知道细胞构建的成千上万个部分,但不知道它们是如何组合在一起的。
在发表于《自然通讯》的一篇论文中,来自基因组调控中心(CRG)的科学家描述了一种称为“rec-YnH”的新方法的发展,该方法旨在了解数百种蛋白质和RNA之间形成的复合物。时间。
该方法由Sebastian Maurer与Luis Serrano实验室合作开发,是第一种允许同时检测大量蛋白质和RNA分子之间相互作用的技术。研究人员强调开发一种可广泛应用的可行且经济的方法。
“我们的方法可以可靠地测量许多蛋白质或许多蛋白质与RNA片段之间的相互作用,而不需要昂贵的特殊设备,”Sebastian Maurer解释道。“这种方法可以被任何标准的生物医学研究实验室使用,它也可以用于研究细胞中的特定过程。同时,这也是研究人员必须一次探索数百万个蛋白质相互作用的方法,以找到参与特定疾病的化合物,”他总结道。
两个CRG实验室成功地结合了他们在生物信息学、生物化学和分子生物学方面的专业知识来实施和验证该方法。“我们的合作产生了一种经济可行的方法来生成高质量的蛋白质-蛋白质和蛋白质-RNA相互作用的地图,”博士后研究员兼论文的第一作者Jae-Seong Yang说。
“蛋白质和RNA之间的相互作用是许多生物过程的关键,包括基因调控。我们的方法是第一个可以同时检测蛋白质和RNA之间数百种相互作用的方法。拥有这样一个高效的新工具对于回答与许多疾病相关的重要问题非常重要,”该研究的第一作者和CRG研究员Mireia Garriga说。