约翰霍普金斯大学病理学院，约翰霍普金斯金梅尔癌症中心，约翰霍普金斯大学医学院的研究人员据信是迄今为止最常见的头颈癌类型最全面的分子表征，美国和波兰的其他18个中心已经阐明了这些癌症中与癌症相关的关键基因，蛋白质和信号通路的作用，同时提出了可能的新治疗途径。

他们在1月7日的《癌细胞》杂志上对HPV阴性的头颈鳞状细胞癌(HNSCC)进行了深入研究，涉及108名尚未接受癌症治疗的患者的肿瘤以及66例健康的样本肿瘤周围的组织。这项研究系统地分类了HPV阴性的HNSCC相关蛋白，磷酸位点(它们被磷酸基团修饰的区域)和信号传导途径，发现了HNSCC的三种不同亚型。

HNSCCs出现在上呼吸道的细胞中，包括嘴唇，嘴巴，舌头，鼻子，喉咙，声带以及部分食道和气管。研究人员确定的第一个HNSCC亚型称为CIN，预后最差。它与喉，吸烟史和染色体高度不稳定性有关。因为这种亚型与CCND1和CDKN2A基因的频繁畸变以及CDK4和CDK6酶的高活性有关，所以这种类型的癌症可能对称为CDK4 / 6抑制剂的抗癌药物反应最好。

第二种亚型被称为基础蛋白，表现出几种基础因子的蛋白质升高，这是激活基因转录所需的最基本的蛋白质。它的特征是在称为EGFR(表皮生长因子受体)的信号转导通路中具有高活性，并具有与EGFR肿瘤蛋白连接的称为AREG和TNFA的分子的高表达。因此，研究人员说，这些癌症对称为EGFR的单克隆抗体的抗癌药物反应最好。

在不吸烟的人的肿瘤中发现了第三个亚型，称为免疫，并显示了多种免疫检查点蛋白的高表达。研究人员说，这些肿瘤可能对称为免疫检查点抑制剂的抗癌药物产生最佳反应。总体而言，有32%的CIN肿瘤，62%的基础肿瘤和83%的免疫肿瘤具有建议的治疗潜力。

研究人员还发现了EGFR的两种激活模式，这表明了一种新的策略，可根据与EGFR结合的分子数量对HNSCC进行分层，以有效利用单克隆抗体药物有效地治疗天然免疫系统以对抗癌症。此外，他们指出，这些癌症中免疫调节基因的广泛缺失导致产生免疫反应的能力下降。

Daniel Chan博士说：“这项研究扩展了我们对HPV阴性HNSCC的生物学理解，并产生了治疗假说，可作为针对这种侵袭性癌症类型的分子指导的精确医学治疗的未来研究和临床试验的基础。”约翰·霍普金斯大学医学院首席研究员，病理学和肿瘤学教授，生物标记物发现和翻译中心主任。

张辉博士说，这三种亚型和建议的治疗方法“是相当主要的发现”。，这项研究的共同负责人，病理学和肿瘤学教授，以及约翰霍普金斯大学医学院的质谱核心机构主任。“以前，将使用不同的选择来治疗患者，但是没有系统的方法来知道哪种治疗将是某些患者的最佳选择。”她说，研究小组已经开始进行类似的工作，以弄清HPV阳性HNSCC的特性。

研究人员使用了最先进的基因组学和蛋白质组学技术来研究HNSCC蛋白质组